Kiedy zwykłe leczenie kanałowe nie wystarcza stomatolodzy sięgają po specjalny mikroskop stomatologiczny , który ułatwia im pracę nad cięższymi przypadkami. Jego zastosowanie diametralnie zmieniło współczesną endodoncję. Dzięki powiększeniu pola zabiegowego, które daje mikroskop można dostrzec przewężenia i zamknięcia kanałów korzeniowych, które znacznie komplikują cały zabieg. Poza tym pozwala on na wykonywanie bardzo precyzyjnych ruchów koniecznych np. przy usuwaniu złamanych narzędzi czy zamykaniu kanału.